GSEA와 ssGSEA
ssGSEA는 GSEA와 다르게 각각의 sample과 geneset간의 enrichment score를 계산해 준다는 것이 특징 (GSEA는 샘플 그룹별 enrichment score계산한다).
Recent Posts
OOP 과연 좋은 것 일까?
Medium을 둘러보다 “Goodbye, Object Oriented Programming” 이라는 제목이 눈에 띄어 보게 되었다.
AWS (Amazone Web Service)에 Django 세팅하기
AWS (Amazon Web Service) 와 같은 클라우드 서비스를 이용하면 필요한 만큼, 필요할때마다 원하는 성능의 서버를 사용할 수 있다. 특히 고성능의 서버가 필요한 빅 데이터 분석에서 하드웨어를 구입하지 않고 클릭 몇 번으로 원하는 서버를 구축할 수 있다는 점은 매우 큰...
Python으로 venn diagram 그리기
python으로 venn diagram을 그릴 수 있게 해주는 matplitlab의 venn2, venn3은 그룹 3개를 최대로 그릴 수 있다. 하지만 분석을 하다보면 4,5,6개 그룹으로 이루어진 venn diagram을 그려야 하는 경우도 많이 생긴다.
Django에서 Celery 사용하기
Celery는 task queue를 관리하는 파이썬기반 패키지임. 버전 4.2까지 나옴. 이전에는 Django와 Celery각각 개별 라이브러리로 세팅해야했는데 버전3.1부터는 Celery가 django와 통합되어서, 더 쉽게 이용가능해짐